La navegación por el río está gestionada por la empresa ROSENBERGER – Lipno – Line que dispone de dos grandes embarcaciones, Adalbert Stifter y Vltava.
Desde abril hasta finales de octubre, el barco Adalbert Stifter navega principalmente en la mitad sur del lago, entre las ciudades de Lipno nad Vltavou y Frymburk. Además del transporte en barco, también organiza cruceros muy populares, como los que hace al atardecer.
Antes de la temporada principal de verano, el barco Vltava ofrece servicio a grupos organizados y a grupos escolares. Durante la temporada alta lleva a turistas y ciclistas en rutas regulares por toda la presa de Lipno y en la zona norte del lago, entre las poblaciones de Horní Planá y Černá v Pošumaví.
Los horarios de servicio de ambos barcos se encuentran en la página web de la compañía: www.lipno-line.com