Daný objekt sloužil od roku 1907 jako synagoga, a to až do nacistické okupace. Po II. Světové válce jej začala ke svým účelům využívat Církev Československá (husitská) a v r. 1960 objekt zakoupila. V r. 1992 byla samostatná náboženská obec v Hluboké nad Vltavou zrušena. Od té doby budova chátrala. V r. 2006 byl prostor zakoupen Pražskou diecézí a probíhaly v něm nutné opravy. V r. 2013 byl slavnostně znovuotevřen prostor Husova domu, který se nachází v budově bývalé synagogy.