Klasztor augustianów założony został w 1455 r. przez Petra z Lindy. Niewielki wirydarz klasztorny otoczony jest późnogotyckimi krużgankami ze sklepieniem sieciowym. Wieża po północnej stronie kościoła stała się po przebudowie w 1729 r. charakterystyczną dominantą miasta. W XVIII w. w czasach proboszcza Augustina Dubenskiego powstała klasztorna prałatura nazywana także „pałacem“. Po rozwiązaniu klasztora przez Josefa II w 1785 r. majątek odkupili Schwarzenbergowie, dlatego też ich herb znajduje się na wjazdem do pałacu. W 1939 r. sprzedali pałac miastu, które urządziło tu szkołę. Pałac, udostępniony do zwiedzania po remoncie generalnym od 2010 r., oferuje dwie trasy zwiedzania, a w każdy drugi lipcowy weekend odbywa się tu tradycyjne borovańskie Borówkobranie.
Ciekawostka:
Na krużganku klasztora umieszczono lapidarium barokowych rzeźb z oryginałem słupa morowego z Czeskich Budziejowic. Na piętrze działa muzeum klasztorne, gdzie znajdują się oryginały rzeźb z římovskej drogi krzyżowej.